NC旋盤でのワークシフトに関して

現在使用しているNC旋盤(フジ機械製・制御装置Fanuc 0i)の加工プログラムに関して、教えて頂きたいことがあります。

座標系設定(ワークシフト)(G50)を使用しており、製品ごとに工具長補正を変えずにプログラム変更のみで段替えをしているのですが、たまに他の人がが先頭に入っているG50を読み込まず、シーケンスサーチを行い、加工するため工具が破損する時があります。
現在見直しを掛け、G50を使わない状態にしているのですが、
段替え時に工具補正を取り直す必要があり、手間がかかるような状態です。

各工具ごとにG50で座標系設定を行えば、シーケンスサーチをしてもいいのでしょうか。
弊社の使用しているプログラムでは、インクレメンタルG50W-20.0のような形で、
座標系設定(ワークシフト)されており、この部分をG50Z・・・のような形に変えれば、どの位置に工具があろうとも必要な分だけワークシフトできるものなのでしょうか。

インクレメンタルのものを各工具に入れたら、どんどんずれてしまったため、
なにかいい方法がないかと思い、質問させて頂きました。

マシニングのG54・G55のような形でもいいのかと思いますが、座標系が指定できない機械もありました。



例)
O0001
G99G97G0G40T00M66
G28U0.W0.
G50W-32.05
M57
M1

N1
G99G96T100
G0X100.9Z1.T101S220M3
G1Z-15.0
~
G0Z80.G97S1000
T100M9
M1

N2
G99G97T200
~~~
X100.Z45.
T200M9
G0Z65.M5
G50W32.05
M59

N777

M9
G28W0.
T100M65
M35
M36
M30