真空成型について

接地面にできるのであれば　ゴミの付着ではないかと思います。
アクリルは　静電気が起きやすいので　保護紙をはがした後　加熱するまでのあいだに　ゴミが付着する　ということが考えられます。
型のほうにもゴミがついていないか　チェックします。
空気清浄機で浮遊ごみを減らす。
アルコールを含ませた布でふく。(ゴミのふき取りと静電気の消去を兼ねる。)

引ける前に固まってしまうか
空気の抜けが悪いか
だと思います
余熱をかけたままバキュームするか
抜けの悪いところに空気穴をあければいいと思います

http://www.matsuba-jp.com/faq.html
http://www.yodapla.co.jp/equipment/
http://www.fvf.co.jp/technology/index3.html
http://fukuokagousei.co.jp/product_01_sinku_seikei.html
質問文から「ストレート真空成形」或いは「エアスリップ真空成形」と推定できる

いずれにしても樹脂内部に気泡が出来たとするならば
成型する以前の加熱工程で気泡が発生してるでしょう

先の方のお答えへのコメントで気になったのですが、気泡というのは樹脂内部にできているのですか？それとも型と樹脂の間に気泡が出来ているのですか？これは全く異なった問題ですから、そこら辺をはっきりしないと答える側としてもどう答えて良いのか判断できません。

もう少し具体的に例えば型に当たる側が意匠にかかわる外側になるのか、意匠には影響しない側なのか？木型とありますが、一般的には金型を使うと思うのですが何か理由があっての事なのか？など、あなたのお持ちの情報を出来るだけ細かく書かれることが解決の近道かと思います。文章にするのが苦手というのであれば、使用されている環境を箇条書きでも良いので情報を出来るだけ細かく書かれることをお勧めします。なんとなくわかるのは雄型が無い状態で雌型と何らかの方法で密閉された空間の間に樹脂を挟み込み雌型側からサクションしつつ反対側から加圧しているように思えるのですが、通常ブローまたはバキュームのいずれかだけで事足りるはずなのですが・・今一つ状況がつかめません。

ご説明では、状況がいまいち把握しにくいのですが、
簡単に言えば、邪魔をしている空気を逃がしてやればいいので、
製品に影響のない、小さな空気穴を何か所か空ければいいのではないでしょうか？