同軸度についての質問とは？

ローダーで脱着している様ですが、試しに手でワークの脱着を行い、もし
同軸度が安定する様でしたら、ローダーの脱着に問題があると思います、
試しに、外径39.98ｍｍのピンゲージ（長さ70ｍｍ位）を作製して、チャックの爪の振れが安定しているか確認するのも手だと思います。

素材の把握部の精度バラツキも影響する要素となります。

油圧チャックに簡易的にコレットを使える治具があります。

本来、高精度のエアーチャックやコレット式を使うべきでしょう。

チャックのグリスＵＰも忘れずに

爪のストロークは出来るだけ少なく設定して下さい。

やはりチャックの詰めの傷あるいはチャックの駆動異常だと思います。
チャックを分解清掃した上　友加工する必要があると思います。
浸炭の爪であれば研磨ですけど
私はリューダーを刃物台に固定して少し削ります。
しかしこの場合　ＮＣ旋盤であれば補正がどれだけしてあるかが問題です
いや　作業者が行う補正ではなく　その旋盤を製造した時の補正ですが
パラメーターの補正を解除して行うのですが
おそらくしくても５μ以内にはおさまると思います。
それより　生爪使ってはいかがですか
ワークの寸法と同じにすればルーロも少なくなると思いますよ。
私は汎用旋盤使ってますが　以前はＮＣ旋盤の組み立てしてました。

旋盤であれば、サンドビックのコロマントキャプト（XYZ共脱着繰返し精度±２μｍ以内）を使用して加工してみてはいかがでしょうか。

機外で使用するカッティングヘッドの寸法を測定して、機械に補正値として入力することで、高精度で加工する事が可能です。機械などの条件がよければ±10μmであれば、可能性あると思います。

詳細は、サンドビックへ問い合わせてみてください。（24時間対応で受け付けてます。）

コロマントキャプトの場合、カッティングヘッドの取り付け繰返し精度がXYZ方向とも±２μmと良い為、チップ交換ではなく、カッティングヘッドの交換により高精度を維持するという考え方です。つまり、チップ交換をした場合、芯高などの狂いにより精度のばらつきが発生する場合がありますが、キャプトの場合、カッティングヘッドを機外で測定を行い（X、Y、Z方向など加工によるます）、その補正値を機械に入力することで、最初の加工物とほぼ同じ精度のものをバラツキなく製造することが可能だという事です。同じものを続けて加工する場合に良いのではないかと思いまして投稿させていただきました。

サンドビックのプロダクティビティセンターに行って実際に加工を見ましたが、
確かに機械などの条件にもよりますが、±10μmくらいに寸法が入ってましたので、精度的には、かなり良いのではないでしょうか。

詳細は、メーカーにお問い合わせ願います。